Il est difficile de trouver une variable permettant d’identifier les différents types d'unités de méthanisation. Les caractéristiques les plus communément retenues sont :

• Les types de porteurs : agriculteur seul (à la ferme) ou en collectif, collectif divers (unité centralisée), station d’épuration, industriel, collectivité ;
• Les types d’intrants : agricole, boues de station d’épuration, résidus de l’agroalimentaire, autres résidus organiques ;
• Les choix techniques : procédé technique de méthanisation en voie sèche ou humide, notamment, existence de prétraitements des intrants et de post-traitements du digestat, etc.
• La taille de l’unité : puissance développée, tonnage de matières traitées ;
• La valorisation du biogaz : cogénération, injection, production de bioGNV, etc.

D’autres caractéristiques pourraient être également considérées comme pertinentes comme les types de financeurs, l’année de construction ou encore le statut juridique de l’unité. Néanmoins, il reste nécessaire de définir des types d’unités au-delà d’une liste de caractéristiques. Berthe et al. (2021) proposent quant-à-eux de retenir cinq modèles organisationnels en France d’unité de méthanisation agricole :