Comme toute matière épandue dans les champs, le digestat fait l'objet de plans d'épandage. Cela consiste à analyser  les conséquences potentiellement défavorables de l'épandage du digestat, en particulier aux abords des champs, et à ne proposer que des terrains sur lesquels l'épandage ne posera pas de problème.

A ce jour, les études disponibles montrent que l'épandage du digestat n’entraîne pas plus de dispersion des nutriments dans les eaux ni de risque sanitaire que les engrais minéraux ou les engrais organiques.

Par rapport à d'autres engrais organiques (fumiers ou lisiers bruts en particulier), le digestat est moins odorant et permet donc d'éviter  les mauvaises odeurs dans les jours qui suivent l’épandage.